RNA探针采用示踪物进行标记,通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、荧光染料等,这些示踪物具有自显影或者发光效果,以达到高灵敏检测效果。
RNA探针,是生物探针的一种,属于核酸探针,是能与相对应核酸序列进行互补结合的一段核酸分子,根据来源来看,主要包括单链cDNA探针、cRNA探针、寡核苷酸探针三种。
RNA探针的核酸分子为单链,需经过示踪物标记,然后与靶核酸序列进行杂交,形成双链,对标记物进行探测,可获得样品中是否含有目标核酸序列,以及含量的多少与位置。RNA探针核酸分子的选择需要关注核酸分子的特异性、制备与标记难易程度、杂交稳定性等,早期采用的RNA探针主要是细胞mRNA探针、病毒RNA探针,标记难度较大,应用受到限制。
根据新思界产业研究中心发布的《2024-2028年RNA探针行业深度市场调研及投资策略建议报告》显示,目前常见的RNA探针细分产品中,单链cDNA探针,对相应基因进行转录,获得mRNA,再经逆转录获得cDNA,制备过程较为复杂;cRNA探针,以cDNA为模板,经过体外转录获得cRNA,制备难度较大;寡核苷酸探针,体外人工合成的与目标基因序列互补的单链核苷酸片段,对片段长度范围要求较高,标记物携带有限。这些不同类型的RNA探针产品各有优缺点。
RNA探针采用示踪物进行标记,通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、荧光染料等,这些示踪物具有自显影或者发光效果,以达到高灵敏检测效果。例如以地高辛标记的RNA探针为例,可以利用琼脂糖凝胶电泳检测片段长度,利用斑点杂交实验验证探针灵敏度,杂交完成后标记物检测方便。
与DNA探针相比,RNA探针具有可改良杂交印迹、杂交反应效率高的优点,但仅能够在体外转录过程中进行标记,且不稳定容易被降解。因此RNA探针一般不应用在检测领域,主要应用于科研领域。RNA探针可以广泛应用在动物、植物、微生物、病毒等基因编辑研究领域,例如HIV病毒基因组DNA克隆研究方面。
新思界行业分析人士表示,在全球范围内,RNA探针提供商主要有瑞士Roche、荷兰Biolegio、英国Bioline、美国Sigma-Aldrich、美国Empire Genomics、美国Bio-Techne、美国Promega、中国台湾Abnova Corporation等,主要集中在美国地区,其次是欧洲地区。
我国科研实力不断进步,RNA探针作为重要工具,研究还在不断深入。2024年3月,中国科学院大连化学物理研究所研究团队,发展了能够与RNA特异性可逆结合,在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN,实现了对核仁动态轮廓的成像。
原文标题:【洞察】RNA探针细分产品各有优缺点 我国相关研究不断深入
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